Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms