Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNS3Q9BQ31 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms