Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms