Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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