Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms