Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms