Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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