Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE2Q96FN4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms