Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms