Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAF2Q96CS3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms