Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms