Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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