Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRAT1Q92837 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms