Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms