Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX33Q8WV41 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms