Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf43Q8TAL5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf43Q8TAL5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms