Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAAF3Q8N9W5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms