Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C9orf40Q8IXQ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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