Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms