Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms