Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SCXQ7RTU7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms