Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms