Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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USP43Q70EL4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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