Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms