Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC141Q6ZP82 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC141Q6ZP82 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms