Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPPQ6IPU0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms