Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms