Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3BQ5T9A4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms