Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCID2Q5JVF3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms