Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms