Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms