Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms