Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms