Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms