Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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