Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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