Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FHOD3Q2V2M9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms