Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC96Q2M329 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC96Q2M329 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC96Q2M329 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC96Q2M329 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC96Q2M329 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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