Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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