Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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