Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HADHQ16836 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms