Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PTPROQ16827 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PTPROQ16827 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PTPROQ16827 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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