Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GABRA6Q16445 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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