Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1EQ15878 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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