Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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