Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms