Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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