Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms