Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms