Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms